chr1	2221868	2222548	2222316	Y	TNFRSF14,SKI	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf86	79709	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	2380992	2381349	2381299	Y	NA	PEX10	PRDM16	IMR90	Hi-C	24141950	PEX10	37756	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	6221566	6221669	6221628	Y	PLEKHG5,CHD5	RPL22	NA	NA	NA	NA	RPL22	45780	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr1	9760502	9760837	9760631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM201	113570	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr1	16677236	16677843	16677569	Y	ZBTB17,FBXO42	FBXO42	RSG1	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO42	287	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	NA	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	NECAP2	60166	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	NA	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	ATP13A2	95640	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	19337577	19337942	19337698	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	56397	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	20693127	20693202	20693146	Y	KIF17,PINK1	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2N1	117511	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	20930711	20931037	20930891	Y	CDA	PINK1	PINK1	IMR90	Hi-C	24141950	PINK1	26911	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	22836447	22836690	22836500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB40	60103	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	24691833	24692082	24691893	Y	PNRC2,GRHL3	NIPAL3	NA	NA	NA	NA	NIPAL3	48202	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	27863218	27863465	27863342	Y	NA	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	48549	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	31602770	31603168	31602969	Y	NKAIN1	NA	PRO0611,PUM1,NKAIN1,SNRNP40	IMR90	Hi-C	24141950	PUM1	65932	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	90728	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	36839449	36839891	36839558	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	9606	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	41564044	41564297	41564171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFYC	408724	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	46528388	46528566	46528496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	110179	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	48935854	48936015	48935919	Y	NA	SPATA6	NA	NA	NA	NA	SPATA6	9	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	54695028	54695502	54695289	Y	NA	MRPL37	NA	NA	NA	NA	MRPL37	47314	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	55400798	55400903	55400847	Y	NA	DHCR24	DHCR24,TMEM61,BSND,TTC22,USP24,HEATR8-TTC4	IMR90	Hi-C	24141950	DHCR24	49907	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	56797894	56798374	56798151	Y	NA	NA	PPAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	PPAP2B	310600	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	59083966	59084335	59084186	Y	NA	NA	TACSTD2,OMA1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	OMA1	73492	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	59608749	59609120	59609039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-794H19.4	124690	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	60216360	60216669	60216553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	456050	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	66277656	66278058	66277920	Y	LEPROT,LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	NA	LEPROT	393386	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	67460593	67460710	67460683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIER1	72015	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	85241214	85241288	85241250	Y	SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,SSX2IP,SSX2IP,LPAR3	NA	SSX2IP,GNG5,TTLL7,UOX,MCOLN2,C1orf180,PRKACB,LPAR3,MCOLN3	IMR90	Hi-C	24141950	SSX2IP	86728	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	87190718	87190974	87190846	Y	NA	SH3GLB1	NA	NA	NA	NA	SH3GLB1	22459	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	94021310	94021626	94021469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	109622	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	94023703	94024059	94023930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	112015	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	94158601	94159338	94158654	Y	GCLM,DNTTIP2,BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR760	151050	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	9.7420139310738
chr1	94795618	94795987	94795955	Y	NA	NA	ARHGAP29,ABCA4,ABCD3	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP29	56994	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	97596064	97596178	97596116	Y	PTBP2	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP2	410843	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	105320877	105321094	105320986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNPC3	1254564	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	110694968	110695154	110695000	Y	KCNA2,SLC6A17	SLC6A17	NA	NA	NA	NA	SLC6A17	3860	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	115732772	115733197	115732900	Y	NGF	NA	NGF	IMR90	Hi-C	24141950	SIKE1	411466	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	119526348	119526895	119526588	Y	NA	TBX15	NA	NA	NA	NA	TBX15	3284	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	120686768	120686908	120686886	Y	ZNF697,NOTCH2	NA	NA	NA	NA	NA	NOTCH2	76528	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	150949569	150950014	150949933	Y	ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A	CERS2,FAM63A,PRUNE	NA	NA	NA	NA	CERS2	4090	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	152140379	152140745	152140485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	S100A11	121996	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	5.84520835864428
chr1	154699087	154699216	154699140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAR	100612	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	11.6904167172886
chr1	155830201	155830522	155830413	Y	ASH1L,MEX3A,ARHGEF2,ARHGEF2	GON4L,SYT11,RIT1	ARHGEF2,RXFP4,SNORA42,RIT1,KIAA0907	IMR90	Hi-C	24141950	SYT11	2901	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	LMNA	NA	NA	NA	NA	LMNA	44669	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	157244599	157245063	157244641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV3	138333	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	157989414	157989935	157989469	Y	KIRREL	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	28351	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	159859603	159860031	159859945	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	C1orf204,SLAMF8	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC19	7922	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	5.84520835864428
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	77619	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	167772811	167773182	167772825	Y	CREG1	NA	NA	NA	NA	NA	MPZL1	84382	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	169452813	169453010	169452905	Y	NA	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	SLC19A2	231	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	172142638	172142648	172142642	Y	DNM3,FASLG	MIR199A2	NA	NA	NA	NA	MIR199A2	30854	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	172790579	172790978	172790769	Y	NA	NA	CENPL,DARS2,TNFSF4,LOC100506023,RC3H1,SERPINC1,TNFSF18	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	379349	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	182143008	182143387	182143211	Y	RNASEL,GLUL,GLUL	NA	NA	NA	NA	NA	GLUL	215954	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	183865521	183866190	183865847	Y	NCF2,NCF2,ARPC5	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	152621	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	186612873	186613046	186612917	Y	PTGS2,PLA2G4A	PTGS2	NA	NA	NA	NA	PTGS2	34513	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	200379777	200379959	200379899	Y	NA	ZNF281	NA	NA	NA	NA	ZNF281	2593	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	201711711	201712036	201711993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPO9	84233	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	201768733	201769083	201768901	Y	NA	IPO9,IPO9-AS1	IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	IPO9	27186	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	203101073	203101246	203101163	Y	NA	MYBPH	NA	NA	NA	NA	MYBPH	41695	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	PRELP	NA	NA	NA	NA	PRELP	39026	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	203526746	203526853	203526757	Y	NA	NA	ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	66836	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	221982394	221982755	221982569	Y	DUSP10,DUSP10	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	68876	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr1	225721902	225722011	225721957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LBR	107275	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	225895377	225895885	225895482	Y	ENAH	RP11-145A3.1	ENAH,TMEM63A,SRP9,EPHX1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-145A3.1	9071	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	228783962	228784250	228784107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF187	111200	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	NTPCR	318224	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	40.9164585105099
chr1	234793934	234794239	234794125	Y	NA	NA	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TARBP1	181085	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	234908151	234908764	234908277	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TARBP1	295302	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	235151923	235152024	235152010	Y	ARID4B	NA	LINC00184,LOC100506795,IRF2BP2,LOC100506810	IMR90	Hi-C	24141950	TOMM20	138227	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	237634251	237634535	237634324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	677641	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	240405898	240406270	240405998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	74443	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	245810793	245811072	245810933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	494506	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr1	246469940	246470214	246470139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	198400	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	2249906	2250005	2249935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFKP	856520	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	3808656	3808872	3808754	Y	KLF6	KLF6	NA	NA	NA	NA	KLF6	16601	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	4283808	4284356	4284092	Y	NA	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	0	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	5.84520835864428
chr10	4386754	4387085	4386858	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	102650	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	5590959	5591270	5591035	Y	NET1	RP13-463N16.6	NA	NA	NA	NA	RP13-463N16.6	44811	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	10961230	10961616	10961402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFTA1P	126287	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	13908290	13908478	13908416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	281363	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr10	15178441	15178844	15178745	Y	NA	RPP38,NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	29848	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	15250805	15251188	15250997	Y	CDNF,MEIG1,C10orf111	NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	42113	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	17044035	17044524	17044318	Y	VIM,TRDMT1,ST8SIA6	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	186508	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	22629825	22629981	22629966	Y	DNAJC1	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	21685	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	25190845	25191315	25190947	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENKUR	111774	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	28366743	28367106	28366855	Y	ARMC4	NA	NA	NA	NA	NA	ARMC4	80766	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	33272272	33272613	33272373	Y	ITGB1,ITGB1,ITGB1	ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	20107	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	33415871	33415993	33415948	Y	NA	NA	ITGB1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	123151	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	33562254	33562552	33562425	Y	ITGB1,ITGB1,NRP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	60638	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	47129494	47129670	47129546	Y	SYT15,PPYR1	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	160094	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr10	49814847	49815442	49815148	Y	NA	ARHGAP22	NA	NA	NA	NA	ARHGAP22	46868	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	54293866	54294084	54293893	Y	DKK1	NA	LOC100506939,DKK1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-346D6.6	65573	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	64324371	64324598	64324504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF365	192420	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	72413009	72413391	72413116	Y	ADAMTS14	ADAMTS14	ADAMTS14,PRF1,KIAA1274,C10orf27,SGPL1,PCBD1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ADAMTS14	17168	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	72416244	72416577	72416419	Y	ADAMTS14	ADAMTS14	ADAMTS14,PRF1,KIAA1274,C10orf27,SGPL1,PCBD1	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS14	13982	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr10	72973788	72974249	72973953	Y	UNC5B	UNC5B	NA	NA	NA	NA	UNC5B	3461	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	74765472	74765512	74765492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	P4HA1	89220	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	78190160	78190348	78190225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF503	1030496	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	80737664	80737999	80737882	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	88793	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	95218561	95218998	95218660	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	21076	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	9.7420139310738
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr10	104473144	104473537	104473339	Y	NA	ARL3	NA	NA	NA	NA	ARL3	980	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	110360095	110360471	110360395	Y	NA	RP11-163F15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-163F15.1	40522	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	112158460	112158738	112158533	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	95751	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	123027203	123027438	123027321	Y	NA	NA	FGFR2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-159H3.1	135966	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	126397729	126397974	126397834	Y	FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	32864	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	128947297	128947480	128947351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK1	355319	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr10	133794080	133794414	133794353	Y	NA	BNIP3	PPP2R2D	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	645	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM3,B4GALNT4	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	6523174	6523531	6523244	Y	OR2D2	TRIM3,ARFIP2	NA	NA	NA	NA	ARFIP2	22508	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	8273804	8274153	8274013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUB	235013	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr11	9786985	9787566	9787311	Y	NA	SBF2-AS1	NA	NA	NA	NA	SBF2-AS1	9146	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	7.79361114485904
chr11	10948023	10948274	10948153	Y	NA	NA	EIF4G2,MICALCL,LOC729013,ZBED5,CTR9,GALNTL4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZBED5	69680	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	12097914	12098716	12098251	Y	PARVA,MICALCL,MICAL2	MICAL2	MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	14827	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr11	12101706	12102070	12101803	Y	DKK3,DKK3,PARVA,MICALCL,MICAL2	MICAL2	MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	11473	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	12188567	12188982	12188726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	75024	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	12306799	12307179	12306992	Y	MICAL2,PARVA	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	89553	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	27739901	27740316	27740092	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	1289	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr11	34255626	34256042	34255739	Y	LMO2,LMO2,ABTB2	NA	NA	NA	NA	NA	ABTB2	121513	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	35052236	35052689	35052493	Y	CD44	NA	SLC1A2,CD44,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	105728	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	35188303	35189153	35188420	Y	CD44	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	29886	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	39183372	39183493	39183434	Y	NA	RP11-313M3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-313M3.1	2369	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	9.7420139310738
chr11	46619183	46619437	46619308	Y	NA	AMBRA1,ATG13	AMBRA1	K562	ChIA-PET	22265404	AMBRA1	5508	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	58340867	58341571	58341167	Y	OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN	ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	ZFP91	3013	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	62310227	62311393	62310863	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	78	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	62312037	62312397	62312245	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	566	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	17.5356250759328
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	5.84520835864428
chr11	65670692	65670945	65670845	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	4648	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	65678943	65679154	65679019	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,CFL1,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,KLC2,FOSL1,SART1,DRAP1,C11orf68,BANF1	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5434	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	7.79361114485904
chr11	65782974	65783337	65783107	Y	FOSL1	BANF1,CST6,CATSPER1,SF3B2	NA	NA	NA	NA	CST6	5662	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	67105994	67106296	67106145	Y	NA	SSH3,POLD4,AP003419.11	NA	NA	NA	NA	POLD4	16147	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	70079442	70079825	70079633	Y	ANO1,CTTN,FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1,ORAOV1,ANO1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FADD	32173	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	74608675	74608873	74608772	Y	NA	XRRA1	NA	NA	NA	NA	XRRA1	49372	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	85802534	85802824	85802626	Y	NA	PICALM	PICALM	IMR90	Hi-C	24141950	PICALM	23610	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr11	87133739	87133898	87133788	Y	NA	NA	GRM5,FZD4,LOC100506368	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM135	386853	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	95746570	95746792	95746680	Y	FAM76B	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR2	90091	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	95888064	95888524	95888506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	185820	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	7.79361114485904
chr11	95888692	95889856	95889448	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	184488	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	95982466	95982894	95982863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	91450	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	5.84520835864428
chr11	96040167	96040456	96040282	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	33888	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	102231981	102232209	102232014	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC2	16039	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	102283995	102284326	102284226	Y	BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123	NA	BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM123	54789	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	115017965	115018296	115018131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM1	355379	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	115795812	115796179	115795995	Y	NA	NA	CADM1	IMR90	Hi-C	24141950	CADM1	422137	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	128341794	128342415	128342241	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	113038	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	132764269	132764639	132764489	Y	OPCML	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	1060241	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	133017323	133017551	133017437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	807329	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr11	133804654	133804943	133804849	Y	NA	IGSF9B	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	19937	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	1642572	1643085	1642916	Y	NA	WNT5B	ERC1,LOC100292680,FBXL14	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5B	5515	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	1770869	1771337	1771069	Y	LRTM2,ADIPOR2	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	24403	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr12	2749982	2750016	2749999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP4	152103	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	2862367	2862509	2862453	Y	NA	FKBP4	NA	NA	NA	NA	FKBP4	39610	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	6202352	6202551	6202452	Y	CD9,ANO2	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	104330	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	6444583	6445131	6444861	Y	CD4,CD4,TNFRSF1A	TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	4149	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr12	6717352	6717716	6717682	Y	SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP	NOP2,CHD4	NA	NA	NA	NA	CHD4	2710	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	7034730	7034838	7034794	Y	ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,EMG1,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	3104	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	9055464	9055643	9055504	Y	CLEC6A,CLEC4D,CLEC4E,M6PR	PHC1,M6PR	NA	NA	NA	NA	PHC1	8849	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	12957478	12957757	12957559	Y	GPRC5A	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	6493	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137212	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	43159561	43159769	43159665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRICKLE1	177404	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	51787794	51788248	51788116	Y	SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,CSRNP2,DAZAP2,GALNT6	SLC4A8	NA	NA	NA	NA	SLC4A8	4693	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25762	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	52674655	52675081	52674843	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT81	NA	NA	NA	NA	KRT81	8237	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	52889322	52889458	52889391	Y	KRT75,KRT6B,KRT6C,KRT6A,KRT5	NA	NA	NA	NA	NA	KRT75	63013	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	52890343	52890794	52890475	Y	C12orf44,KRT7,KRT18,KRT18,KRT6A,KRT5	NA	NA	NA	NA	NA	KRT75	64034	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	54563652	54563918	54563802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBX5	107968	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	57360	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	54777021	54777369	54777117	Y	NA	ITGA5	NA	NA	NA	NA	ITGA5	33875	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	7.79361114485904
chr12	59061940	59062339	59062197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG3	249964	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	63025271	63025629	63025492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MON2	166674	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr12	63118880	63119001	63118911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	207816	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	67411263	67411633	67411591	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAND1	249428	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	71037443	71037574	71037509	Y	PTPRR,KCNMB4	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-611E13.2	402303	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	72728711	72729061	72728940	Y	TPH2,TRHDE	NA	NA	NA	NA	NA	TRHDE-AS1	62024	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	76219425	76219952	76219684	Y	PHLDA1	NA	PHLDA1,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA1	205760	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr12	76849053	76849336	76849202	Y	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	102253	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	82114853	82115202	82114865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC59	635382	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	92947125	92947543	92947361	Y	EEA1,BTG1	NA	LOC256021	IMR90	Hi-C	24141950	EEA1	373564	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	101412491	101412895	101412554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP20	258992	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	108054058	108054330	108054150	Y	NA	PWP1	NA	NA	NA	NA	PWP1	23179	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	108700100	108700298	108700252	Y	CORO1C,SELPLG	CMKLR1	NA	NA	NA	NA	CMKLR1	30820	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr12	109030971	109031245	109031128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISCU	76613	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	109032155	109032517	109032383	Y	NA	NA	ISCU,TMEM119,SELPLG	IMR90	Hi-C	24141950	ISCU	77797	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	109036250	109036518	109036431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISCU	81892	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	109088465	109088864	109088838	Y	SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	34508	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	113652796	113652994	113652903	Y	OAS1,OAS3,OAS2,SLC24A6,SDSL,TPCN1	DDX54,TPCN1	NA	NA	NA	NA	TPCN1	3861	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	113660919	113661318	113661188	Y	TPCN1	DDX54,TPCN1	NA	NA	NA	NA	TPCN1	4064	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	114029271	114029455	114029396	Y	LHX5	NA	RBM19	IMR90	Hi-C	24141950	SDSL	171229	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr12	115354392	115354675	115354479	Y	NA	NA	TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	TBX3	234423	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr12	116362516	116362609	116362584	Y	MED13L	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	350534	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	116701070	116701373	116701314	Y	MAP1LC3B2,MED13L	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	11770	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	118157825	118158191	118158007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC5	291202	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	9.7420139310738
chr12	120524802	120525368	120525019	Y	CCDC64	RAB35	NA	NA	NA	NA	RAB35	27938	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	120668258	120668871	120668569	Y	RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	31164	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	124717911	124718282	124718055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM101A	262123	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	124962828	124963212	124962933	Y	UBC	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	402002	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	313839	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	126796414	126796868	126796639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	851804	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr12	132014283	132014643	132014520	Y	NA	NA	GPR133	IMR90	Hi-C	24141950	SFSWAP	178983	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr13	24133122	24133556	24133337	Y	NA	TNFRSF19	MIPEP,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF19	8953	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr13	24722927	24723324	24723037	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIPEP	261369	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr13	29148829	29149214	29148994	Y	POMP	NA	FLT1	IMR90	Hi-C	24141950	POMP	82027	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr13	31439697	31440107	31440029	Y	C13orf33	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX5AP	132052	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr13	40350825	40350889	40350868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG6	123061	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr13	42219317	42219744	42219583	Y	NAA16,C13orf15	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	335976	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr13	42269057	42269475	42269218	Y	C13orf15,DGKH	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	385716	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr13	44359761	44360131	44359976	Y	ENOX1,ENOX1	NA	NA	NA	NA	NA	LACC1	91289	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr13	46745335	46745646	46745526	Y	C13orf18,LCP1	LCP1	NA	NA	NA	NA	LCP1	38360	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr13	64652316	64652644	64652373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRD3	3683725	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr13	74228674	74228703	74228690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	477691	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr13	74708897	74709334	74709161	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	2503	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr13	75800411	75800558	75800473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	253692	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr13	80614628	80615478	80614937	Y	NA	NA	SPRY2	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY2	297608	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr13	93899040	93899272	93899121	Y	NA	GPC6	NA	NA	NA	NA	GPC6	21945	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr13	95201580	95202169	95201893	Y	NA	TGDS,GPR180	NA	NA	NA	NA	TGDS	44342	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr13	99128638	99129073	99128919	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	99121	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr13	108520131	108520835	108520801	Y	LIG4,FAM155A	FAM155A	NA	NA	NA	NA	FAM155A	3048	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr13	110352571	110352699	110352636	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	84216	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr13	111049993	111050394	111050073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	92497	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr13	111064452	111064750	111064655	Y	RAB20	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	106956	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr13	114600157	114600520	114600358	Y	GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	35111	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	269	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr14	21439863	21440073	21439999	Y	NA	METTL17	NA	NA	NA	NA	METTL17	15856	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr14	23584186	23584501	23584299	Y	C14orf119	C14orf119,ACIN1	NA	NA	NA	NA	ACIN1	21363	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr14	29706068	29706381	29706228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKD1	952723	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr14	35250371	35250766	35250653	Y	SRP54,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	NA	CFL2	68342	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr14	51865642	51865984	51865869	Y	FRMD6	RP11-255G12.3	LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-255G12.3	3789	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr14	52110768	52111053	52110947	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	156950	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr14	52622606	52622722	52622664	Y	NA	NA	C14orf166,NID2,PTGDR	IMR90	Hi-C	24141950	NID2	88894	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr14	54649490	54649642	54649566	Y	NA	NA	BMP4	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN3	211925	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr14	58404418	58404760	58404612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P3	201237	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr14	58449709	58450271	58450031	Y	NA	NA	C14orf37	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P3	155726	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr14	58544876	58545175	58545024	Y	C14orf37	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P3	60822	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr14	62040859	62041355	62041035	Y	NA	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	5601	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr14	62051291	62051566	62051431	Y	HIF1A	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	16033	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr14	62157799	62158071	62157921	Y	HIF1A	HIF1A,RP11-618G20.1	NA	NA	NA	NA	HIF1A	2160	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr14	70387825	70388214	70387982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	196208	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr14	71996595	71997083	71996703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L1	211429	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr14	75040596	75041021	75040862	Y	LTBP2	CTD-2207P18.2	ISCA2,NPC2	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2207P18.2	40329	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr14	75777354	75777713	75777592	Y	NA	FOS	NA	NA	NA	NA	FOS	33877	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr14	77384980	77385465	77385224	Y	VASH1	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33887	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr14	77428060	77428442	77428341	Y	NA	RP11-7F17.7	IRF2BPL	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	4079	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr14	79195731	79195991	79195861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRXN3	488997	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr14	89959649	89959712	89959681	Y	TDP1,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	123781	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr14	99827366	99827674	99827539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	117542	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr14	100071651	100072022	100071781	Y	NA	CCDC85C,RP11-543C4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-543C4.1	2758	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr14	105439556	105439771	105439692	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2923	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	7.79361114485904
chr14	105491233	105491512	105491453	Y	NA	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	5748	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr14	105760670	105760918	105760811	Y	C14orf80,C14orf80,C14orf80,GPR132,BRF1	PACS2	NA	NA	NA	NA	PACS2	3982	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,C14orf80	NA	NA	NA	NA	C14orf80	5167	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	26327449	26327665	26327505	Y	NA	NA	ATP10A,LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	ATP10A	219132	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	32974763	32975144	32974961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	69418	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	34531616	34532056	34531745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOP10	101322	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	39175462	39175521	39175492	Y	NA	NA	FSIP1,THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM98B	431134	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	40192845	40193084	40192965	Y	NA	GPR176,EIF2AK4	NA	NA	NA	NA	GPR176	18009	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	40373777	40374114	40374053	Y	FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	24979	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	NA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	TYRO3	106045	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	42091432	42091661	42091502	Y	NA	MAPKBP1,JMJD7,PLA2G4B,JMJD7-PLA2G4B	NA	NA	NA	NA	JMJD7,PLA2G4B	26622	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	42814906	42815063	42814960	Y	NA	SNAP23,LRRC57,HAUS2	NA	NA	NA	NA	LRRC57	23937	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	52369278	52369628	52369325	Y	MAPK6	NA	GNB5,BCL2L10,MYO5C	IMR90	Hi-C	24141950	LEO1	107275	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	62574155	62574333	62574245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLN2	106392	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	9.7420139310738
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	66707547	66707736	66707571	Y	MAP2K1	TIPIN,MAP2K1	RPL4,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K1	30392	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	67488498	67488886	67488594	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	AAGAB	56647	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	68589122	68589626	68589166	Y	ITGA11	CLN6,FEM1B	NA	NA	NA	NA	FEM1B	20981	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	68777268	68777651	68777548	Y	NA	NA	CORO2B,ITGA11,MIR548H4,FEM1B	IMR90	Hi-C	24141950	ITGA11	54767	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	70006588	70006856	70006758	Y	TLE3	NA	C15orf50,TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	RPLP1	263465	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	70022912	70023058	70022988	Y	TLE3	NA	TLE3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPLP1	279789	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	70785060	70785587	70785260	Y	TLE3	NA	KIF23,LOC145837,TLE3,C15orf50,UACA	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	268345	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	74223574	74223817	74223712	Y	LOXL1	NA	NA	NA	NA	NA	STOML1	61146	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	9.7420139310738
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	76543637	76543996	76543963	Y	NA	NA	C15orf27	IMR90	Hi-C	24141950	ETFA	57817	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	77711297	77711794	77711478	Y	NA	PEAK1,HMG20A	NA	NA	NA	NA	HMG20A	543	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	85227339	85227652	85227485	Y	PDE8A,ZNF592,SEC11A	WDR73,SEC11A	NA	NA	NA	NA	SEC11A	30295	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	85455479	85455863	85455740	Y	SLC28A1	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	65808	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	90958026	90958305	90958134	Y	ZNF710,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	28576	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	BLM	NA	NA	NA	NA	BLM	49562	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	99489789	99490246	99490040	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	TTC23	299182	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr15	100651295	100651582	100651483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	379529	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	6882597	6882937	6882663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1736788	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	7473619	7473766	7473686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	1239774	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	8159340	8159643	8159579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	553897	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	9208363	9208890	9208559	Y	NA	C16orf72	NA	NA	NA	NA	C16orf72	24858	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	10759043	10759292	10759209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUBP1	76351	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	14424623	14424858	14424825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	299727	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	17499199	17499488	17499485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15A	1300217	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	23508487	23508934	23508786	Y	GGA2	COG7,GGA2	NA	NA	NA	NA	GGA2	22382	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	23516061	23516396	23516252	Y	PRKCB,GGA2	GGA2,UBFD1	NA	NA	NA	NA	GGA2	14920	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	27254406	27254878	27254778	Y	IL4R	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	23237	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRR14	14153	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr16	50336956	50337409	50337067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY7	58908	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr16	50501772	50501939	50501899	Y	NA	NA	NKD1	IMR90	Hi-C	24141950	NKD1	78302	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	51186041	51186738	51186313	Y	NA	SALL1	NA	NA	NA	NA	SALL1	2763	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr16	51186928	51187269	51186986	Y	NA	SALL1	NA	NA	NA	NA	SALL1	3650	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	51670868	51671078	51670973	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALL1	487590	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	53086726	53087108	53087065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	0	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	53915459	53915524	53915492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	179584	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	56641054	56641530	56641359	Y	MT2A,MT1E	MT2A,MT1A	NA	NA	NA	NA	MT2A	943	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	5.84520835864428
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	NA	NA	NA	NA	NA	KATNB1	50262	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	64944348	64944657	64944578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	213358	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr16	65020062	65020376	65020219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	137639	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	66962213	66962449	66962329	Y	PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD	FAM96B,CES2	NA	NA	NA	NA	FAM96B	3877	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	PLA2G15	5331	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	70973998	70974194	70974080	Y	VAC14	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	140934	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	70980057	70980287	70980181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	146993	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	5.84520835864428
chr16	71046758	71046771	71046763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	213694	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	71070712	71070940	71070844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	237648	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	75278988	75279894	75279594	Y	CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	20057	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	77708958	77709175	77709081	Y	NA	NUDT7	CLEC3A,WWOX,VAT1L	IMR90	Hi-C	24141950	NUDT7	45236	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	77979179	77979195	77979185	Y	VAT1L,WWOX	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	152115	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	86985410	86985767	86985608	Y	FOXC2,FOXL1	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	386553	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	7.79361114485904
chr16	87756631	87757179	87757021	Y	KLHDC4	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	40419	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	88365536	88366092	88365805	Y	ZNF469	NA	BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	151633	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr16	89268043	89268411	89268231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSF3	115260	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr17	597415	597783	597745	Y	NA	VPS53,FAM57A	NA	NA	NA	NA	VPS53	25174	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	1241	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	3289388	3289823	3289641	Y	SPATA22,SPATA22,SPATA22,SPATA22,SPATA22,ASPA,ASPA	NA	NA	NA	NA	NA	SHPK	247793	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr17	4811647	4812042	4811731	Y	NA	RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1	NA	NA	NA	NA	RNF167	29261	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CHD3	39180	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	8057335	8058055	8057702	Y	KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59	VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	0	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	10220640	10220911	10220834	Y	GAS7,MYH4	NA	NA	NA	NA	NA	SCO1	378781	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	16374519	16374788	16374546	Y	NA	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	18679	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	17851403	17851564	17851499	Y	NA	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	22172	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	19967569	19967807	19967644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1	56912	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	21515861	21516199	21516031	Y	NA	C17orf51	CCDC144NL	K562	ChIA-PET	22265404	C17orf51	40139	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	21.4324306483624
chr17	25416172	25416581	25416426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	202521	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	331.228473656509
chr17	25793795	25793989	25793936	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	12125	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	32579434	32580053	32579676	Y	CCL8,CCL7	CCL2,CCL7,CCL11	NA	NA	NA	NA	CCL2	251	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	32586301	32586443	32586414	Y	NA	CCL2,CCL7,CCL11	NA	NA	NA	NA	CCL2	5997	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	36062721	36062883	36062777	Y	DDX52,HNF1B	NA	NA	NA	NA	NA	DDX52	61228	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	38263317	38263642	38263602	Y	NA	MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	8339	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	38480180	38480741	38480429	Y	IKZF3,CASC3,WIPF2,CCR7,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	16736	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	38607821	38607996	38607876	Y	NA	TOP2A	NA	NA	NA	NA	TOP2A	35619	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	38646848	38646954	38646881	Y	KRT222,THRA,RAPGEFL1	NA	NA	NA	NA	NA	TOP2A	74646	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	40670495	40670831	40670653	Y	WNK4,RAB5C,PTRF	NAGLU,COASY,MLX	NA	NA	NA	NA	NAGLU	15359	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	5.84520835864428
chr17	48716257	48716537	48716480	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	6119	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr17	49142836	49143005	49142922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAG9	53221	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	49182545	49182921	49182907	Y	NA	SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2	NA	NA	NA	NA	SPAG9	13305	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	57830594	57831044	57830806	Y	VMP1,RNFT1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	47607	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	62675748	62676312	62676051	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2,LOC146880	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMURF2	19562	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	69617489	69617539	69617508	Y	NA	LOC124685	LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	2370	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	70924179	70924389	70924230	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	162462	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	70939903	70940361	70940187	Y	SSTR2,C17orf80	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	146490	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	72565404	72566131	72565833	Y	TTYH2,TTYH2,CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300C,CD300LD	NA	NA	NA	NA	NA	GPRC5C	146414	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	74526422	74526750	74526585	Y	CYGB	RHBDF2,CYGB	NA	NA	NA	NA	CYGB	18507	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	74705254	74705618	74705431	Y	MXRA7	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	156	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	75251434	75251777	75251766	Y	NA	SEPT9	SEPT9,SRSF2,METTL23,MFSD11,SEC14L1,MGAT5B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEPT9	22874	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	75281811	75282557	75281917	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	7160	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYNGR2	207843	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	76348964	76349371	76349046	Y	USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4787	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	78228476	78228940	78228764	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213	SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	RNF213	3725	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS	NA	NA	NA	NA	TYMS	10579	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	5584856	5584964	5584919	Y	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P27	876050	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	10544333	10544521	10544427	Y	NA	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	20431	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	11005597	11005922	11005792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	481695	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	12048672	12049055	12049000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPA2	69648	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	9.7420139310738
chr18	12288068	12288497	12288213	Y	NA	TUBB6	TUBB6	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB6	17171	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	12839100	12839985	12839163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	87657	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	13568962	13569309	13569097	Y	RNMT,C18orf19,C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	155350	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	20913960	20914007	20913982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM241	101918	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	26744101	26744374	26744185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	988691	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	34813677	34814006	34813844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	406519	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	39520548	39520801	39520707	Y	NA	PIK3C3	PIK3C3	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3C3	12370	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	44392877	44393138	44393020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	102317	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	46482158	46482454	46482304	Y	SMAD7,SMAD7	NA	SMAD7	K562	ChIA-PET	22265404	CTIF	418741	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	47252630	47252839	47252704	Y	LIPG	NA	ACAA2,SCARNA17,MYO5B,LIPG	IMR90	Hi-C	24141950	ACAA2	85491	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	52755312	52755656	52755484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC68	130573	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	54557947	54558232	54558038	Y	WDR7,ST8SIA3	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL1	241116	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	55881305	55881780	55881408	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	171706	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	56161690	56161866	56161857	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	MALT1	174752	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	59968434	59968761	59968590	Y	NA	TNFRSF11A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF11A	21759	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	60828947	60829338	60829223	Y	VPS4B,BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	156023	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	68157445	68157550	68157476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	203308	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr18	76574789	76574960	76574953	Y	SALL3	NA	NA	NA	NA	NA	SALL3	163315	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	9.7420139310738
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	3314117	3314647	3314306	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	42914	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	3404656	3404792	3404728	Y	TLE2,TLE2,PIP5K1C,ATCAY,NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	47095	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	4567148	4567365	4567215	Y	TICAM1,SEMA6B	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L1	70165	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	5091152	5091532	5091191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4B	124027	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	6518032	6518368	6518308	Y	RFX2,CD70,TNFSF9	DENND1C,TNFSF9	TNFSF9	K562	ChIA-PET	22265404	TNFSF9	10642	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	5.84520835864428
chr19	13855893	13856042	13855968	Y	NA	CCDC130,MRI1,C19orf53,ZSWIM4	MRI1,C19orf53	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC130	15319	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	14249278	14249642	14249460	Y	NA	SAMD1,PRKACA,ASF1B	NA	NA	NA	NA	ASF1B	3510	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	18414244	18414595	18414365	Y	NA	KIAA1683,JUND,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	17489	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	18526337	18526644	18526408	Y	CCDC124,IFI30,KLHL26,CRLF1,C19orf60,C19orf50,SSBP4	GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	SSBP4	1030	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	19143307	19143510	19143378	Y	DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6	ARMC6,SUGP2,SLC25A42	NA	NA	NA	NA	SUGP2	475	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr19	23732304	23732710	23732386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF675	135312	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr19	30447917	30448294	30448014	Y	NA	URI1	NA	NA	NA	NA	URI1	35366	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	35809679	35810380	35810036	Y	GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3	NA	NA	NA	NA	NA	USF2	51798	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	37795242	37795359	37795301	Y	ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF829,ZNF568,ZNF420,ZNF585B,ZNF793,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF570,ZNF569,ZNF540,ZNF527,HKR1	HKR1	NA	NA	NA	NA	HKR1	6380	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	37830170	37830469	37830239	Y	NA	HKR1,ZNF527	ZNF527	IMR90	Hi-C	24141950	HKR1	28431	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	39149253	39149575	39149354	Y	SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12964	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	39184148	39184440	39184342	Y	C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	47859	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	41729438	41729579	41729517	Y	ATP5SL,ATP5SL,AXL	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	6330	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	42774379	42774759	42774668	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC	GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	3690	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	5.84520835864428
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr19	45248499	45249479	45248793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL3	0	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	45373382	45373614	45373476	Y	NA	PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	TOMM40	18212	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr19	48222362	48222481	48222377	Y	SEPW1,PLA2G4C,MEIS3,SLC8A2	EHD2,GLTSCR2	NA	NA	NA	NA	EHD2	7762	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr19	49577003	49577438	49577313	Y	SULT2B1,MAMSTR,KCNA7	CGB5,SNRNP70,LIN7B,PPFIA3	NA	NA	NA	NA	SNRNP70	9238	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	50317454	50317522	50317488	Y	PTH2	AP2A1,MED25,PTOV1	NA	NA	NA	NA	MED25	2017	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	51622537	51622653	51622545	Y	SIGLEC7,SIGLEC9	CTU1	CTU1	K562	ChIA-PET	22265404	CTU1	12910	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	FPR1	112596	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr19	54465243	54465494	54465291	Y	TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG7	54654	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	55850120	55850505	55850225	Y	KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564	SUV420H2,COX6B2,IL11,RPL28	NA	NA	NA	NA	SUV420H2	899	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr19	57527489	57527663	57527516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZIM2	177392	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	2617084	2617480	2617333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	762173	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	5.84520835864428
chr2	15049487	15049566	15049527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84A	278677	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	17824489	17824666	17824658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEN1	108459	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	5.84520835864428
chr2	18811449	18811776	18811476	Y	NA	NA	OSR1,NT5C1B-RDH14	IMR90	Hi-C	24141950	RDH14	71503	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	28383730	28384110	28383893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	229205	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	28400759	28401210	28400868	Y	RBKS,BRE,BRE,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	212105	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	28519223	28519459	28519305	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	93856	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	29060448	29060640	29060540	Y	PPP1CB,PPP1CB	TRMT61B	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	30527	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	36665586	36666219	36665918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	84517	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	38409612	38409978	38409795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATL2	192449	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	43647114	43647287	43647224	Y	NA	NA	LOC100129726,ZFP36L2	MCF7	ChIA-PET	22265404	THADA	173898	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	47076896	47077421	47077187	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	63875	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	47077976	47078245	47078111	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	63051	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	47109327	47109734	47109459	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	TTC7A	NA	NA	NA	NA	TTC7A	31562	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	50631357	50631742	50631589	Y	NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	STON1	1876835	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	61580039	61580318	61580309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	115586	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr2	63842322	63842740	63842368	Y	UGP2	MDH1	NA	NA	NA	NA	MDH1	28579	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	65089781	65090129	65089916	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	113642	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	65151416	65151594	65151536	Y	AFTPH,RAB1A,ACTR2,SLC1A4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A4	62017	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	73233755	73233809	73233782	Y	NA	NA	EMX1	IMR90	Hi-C	24141950	SPR	121266	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	74968770	74968998	74968973	Y	TLX2,HK2	NA	HK2,SEMA4F	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEMA4F	89415	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	100323852	100324185	100324151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	219355	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr2	100630312	100630613	100630507	Y	AFF3	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	525815	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr2	102649919	102650192	102650054	Y	IL1RL2,IL1R1,IL18RAP,IL18R1,MAP4K4,MAP4K4,IL1R2	IL1R1	NA	NA	NA	NA	IL1R1	28812	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	106008939	106009297	106009286	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	43673	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	110318153	110318301	110318244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT10	51482	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	113811675	113812041	113811939	Y	IL1A,IL1B,IL36G,IL36B,IL36RN,IL1RN	NA	NA	NA	NA	NA	IL1B	219195	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	23.3808334345771
chr2	113869431	113870096	113869786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1B	276951	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	114039556	114039944	114039632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1B	447076	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr2	114082449	114082815	114082523	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	SLC35F5	429585	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr2	121624920	121625080	121625001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALB	629280	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr2	131058181	131058640	131058440	Y	NA	AC068137.13,IMP4,CCDC115	NA	NA	NA	NA	AC068137.13	8786	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	7.79361114485904
chr2	136242341	136242686	136242514	Y	NA	R3HDM1	NA	NA	NA	NA	R3HDM1	44339	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	148207046	148207397	148207164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	392689	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	151383394	151383753	151383509	Y	RND3	RND3	RND3,RBM43	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RND3	9772	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	159996824	159997456	159997123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	143854	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	161071101	161071394	161071301	Y	ITGB6	NA	ITGB6,RBMS1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4785	190999	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr2	180044911	180045098	180045020	Y	SESTD1	NA	NA	NA	NA	NA	SESTD1	82419	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	190235497	190235832	190235693	Y	NA	NA	COL5A2,GULP1	IMR90	Hi-C	24141950	WDR75	68327	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	191324757	191324843	191324828	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSD6	53676	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	191443312	191443866	191443668	Y	NA	TMEM194B	TMEM194B	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM194B	45864	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	191708638	191708846	191708778	Y	STAT4,NAB1,STAT1,GLS	GLS	GLS,STAT1,NAB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLS	34707	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	192030894	192031017	192030956	Y	NA	NA	STAT1,MYO1B,STAT4,OBFC2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYO1B	76894	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	204547424	204547617	204547518	Y	NA	NA	RAPH1,CD28	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	149291	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	216558345	216558652	216558547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012462.1	259369	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	218088198	218088590	218088283	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,IGFBP2	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP2	592647	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr2	218258363	218258761	218258688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	606957	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr2	218785631	218785811	218785787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	79907	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr2	219434664	219435146	219434778	Y	USP37	USP37,RQCD1	NA	NA	NA	NA	RQCD1	3361	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	227063350	227063523	227063445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRS1	598952	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	227448462	227448628	227448535	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736,NYAP2	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	213847	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	227517160	227517436	227517301	Y	IRS1	NA	IRS1,LOC646736	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	145039	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	230015685	230015803	230015793	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	118198	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	232106599	232106881	232106746	Y	B3GNT7	ARMC9	NA	NA	NA	NA	ARMC9	45339	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	235198516	235198843	235198584	Y	ARL4C	NA	TRPM8,ARL4C	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	204854	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	235748055	235748426	235748121	Y	NA	NA	TRPM8,SH3BP4	IMR90	Hi-C	24141950	SH3BP4	110191	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	237677514	237677881	237677605	Y	NA	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IQCA1	263329	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	237685373	237686074	237685499	Y	CXCR7	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IQCA1	271188	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr2	238508822	238509122	238509050	Y	RAB17,LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	25097	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr2	240196255	240196671	240196554	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	TWIST2	441582	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr2	241373489	241373922	241373594	Y	GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	401	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr20	1398801	1399138	1399021	Y	FKBP1A	FKBP1A	SNPH,RAD21L1,FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495	IMR90	Hi-C	24141950	FKBP1A	26995	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr20	1801326	1801756	1801551	Y	SDCBP2,NSFL1C,SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	SIRPA	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	71398	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr20	4701383	4701758	4701518	Y	NA	PRNP,PRND	NA	NA	NA	NA	PRND	827	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr20	5046140	5046913	5046758	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2	NA	SLC23A2,C20orf30,RASSF2,PCNA,PCNA-AS1,PRND,PRNT,CDS2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC23A2	57201	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr20	15282242	15282264	15282251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	965980	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr20	18686203	18686430	18686281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTD1	119666	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr20	26116339	26116766	26116505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR663A	113396	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	9.7420139310738
chr20	29647996	29648434	29648295	Y	DEFB121,DEFB116	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	38139	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr20	30301047	30301377	30301326	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8415	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr20	32623943	32624156	32623948	Y	NA	RALY,RP5-1125A11.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1125A11.1	43780	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr20	32694090	32694253	32694172	Y	NA	EIF2S2	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	3885	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr20	33908268	33908438	33908376	Y	NA	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	37480	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr20	42381187	42381490	42381296	Y	C20orf111	NA	TOX2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	87433	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr20	45324546	45324927	45324721	Y	TP53RK	TP53RK	SLC13A3,SLC2A10,C20orf123,EYA2,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	TP53RK	8128	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr20	45399106	45399311	45399226	Y	NA	NA	NCOA3,EYA2,ZMYND8,C1orf201	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,19890323	TP53RK	82688	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr20	46097168	46097722	46097476	Y	NA	NCOA3	NCOA3,ZMYND8,EYA2	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA3	30879	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr20	46653872	46653986	46653882	Y	NA	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULF2	240512	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr20	47316327	47316412	47316396	Y	PREX1	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	126008	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr20	48924890	48925591	48925260	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPB	119514	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr20	49598879	49599145	49599015	Y	PTPN1	DPM1,MOCS3,KCNG1	NA	NA	NA	NA	MOCS3	25516	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr20	49982609	49983533	49983215	Y	KCNG1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNG1	344943	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr20	51110040	51110185	51110129	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP64	291193	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr20	52355086	52355238	52355182	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	130640	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr20	55780606	55780977	55780774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAE1	143089	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr20	57198784	57199334	57199089	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16	24994	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr20	59325352	59325574	59325428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH4	499908	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr21	36208387	36209191	36208566	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	222946	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr21	36419290	36419780	36419662	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	433849	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr21	38232574	38232719	38232637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	104093	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr21	38839400	38839766	38839583	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	103308	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr21	39638764	39638897	39638765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ6	352015	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr21	39723755	39724311	39724014	Y	ETS2	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ6	437006	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr21	43460613	43461088	43460825	Y	C2CD2,SLC37A1	NA	NA	NA	NA	NA	C2CD2	88614	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr21	44918002	44918401	44918083	Y	NA	NA	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	72994	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr21	44930607	44930875	44930782	Y	PDXK,SIK1	NA	NA	NA	NA	NA	SIK1	85599	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr21	45020604	45020960	45020754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	56414	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	15.5872222897181
chr21	47010467	47010705	47010586	Y	NA	SLC19A1	PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC19A1	48142	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr21	47291758	47292008	47291998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL6A1	107643	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr21	47563985	47564239	47564071	Y	NA	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	47974	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr22	22478098	22478432	22478244	Y	CCDC116,YPEL1,ZNF280B	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1F	172889	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	9.7420139310738
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr22	27041081	27041748	27041447	Y	SEZ6L,ASPHD2	NA	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	TPST2	50400	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr22	27501495	27502092	27501824	Y	NA	NA	PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1172A22.1	116596	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr22	27503626	27504166	27503976	Y	NA	NA	PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1172A22.1	114522	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr22	27872779	27873029	27872871	Y	NA	NA	PITPNB,TTC28,TTC28-AS1,MN1,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1172A22.1	254091	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	7.79361114485904
chr22	30018031	30018407	30018261	Y	NF2	NIPSNAP1,NF2	NA	NA	NA	NA	NF2	20486	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr22	30440424	30440670	30440589	Y	MTMR3,OSM,CCDC157	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR3	163280	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr22	31689398	31689773	31689585	Y	SMTN,DEPDC5	NA	NA	NA	NA	NA	PATZ1	50445	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr22	32928366	32928835	32928615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	59703	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr22	33243745	33243918	33243862	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	48058	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr22	36149671	36149849	36149827	Y	NA	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	RASD2	214756	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr22	36727482	36728450	36727733	Y	APOL3	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	53613	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr22	37942064	37942352	37942192	Y	KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1	CARD10,CDC42EP1	ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	12102	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr22	38857668	38857748	38857703	Y	NA	KDELR3,DDX17	KCNJ4	K562	ChIA-PET	22265404	KDELR3	4319	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr22	41776948	41777130	41776981	Y	NA	TEF	NA	NA	NA	NA	TEF	15611	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr22	44993593	44993881	44993680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDOC1L	101415	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr22	45664918	45665214	45665118	Y	NA	KIAA0930	LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0930	30268	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr22	46464940	46465203	46464976	Y	NA	MIR4763	NA	NA	NA	NA	MIR4763	42243	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr22	47150443	47150659	47150583	Y	CERK,TBC1D22A	CERK,TBC1D22A	CERK	MCF7	ChIA-PET	22265404	TBC1D22A	5859	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr22	47848340	47848433	47848387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-191L9.4	176990	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr22	48959888	48960020	48959956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-191L9.4	934465	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr22	49768624	49768992	49768711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C22orf34	280198	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	5.84520835864428
chr22	49769098	49769971	49769308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C22orf34	279219	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr22	50329443	50330313	50330025	Y	TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	19337	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	8888	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	5065036	5065378	5065161	Y	BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	45390	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	8540908	8541201	8541046	Y	NA	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	192	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	14579717	14580123	14579927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC6A6	137641	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	16381472	16381685	16381579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	76766	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	25796078	25796406	25796226	Y	NGLY1	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	26002	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr3	30723230	30723490	30723363	Y	TGFBR2	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR2	77236	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	31149741	31150063	31149903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	422067	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	32526070	32526309	32526138	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	16591	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	37164159	37164535	37164493	Y	NA	NA	MLH1	IMR90	Hi-C	24141950	LRRFIP2	58645	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	309173	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	11.6904167172886
chr3	46030448	46030637	46030500	Y	CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1	FYCO1	NA	NA	NA	NA	FYCO1	4679	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	50664800	50665228	50664999	Y	GNAI2,MAPKAPK3	MAPKAPK3,MIR4787,DOCK3	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	17849	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	55363946	55364201	55364163	Y	WNT5A	NA	CACNA2D3,WNT5A,ERC2,C3orf51	IMR90	Hi-C	24141950	ERC2	1136190	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr3	56443112	56443203	56443174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERC2	57188	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	64136720	64136844	64136782	Y	THOC7,PSMD6	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD6	129062	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	80100853	80101105	80100983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	285888	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	80819406	80819881	80819642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	989431	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	11.6904167172886
chr3	80820355	80820528	80820440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	988784	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	86999128	86999300	86999212	Y	CHMP2B	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP2B	275121	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	110559654	110560043	110559944	Y	NA	NA	PVRL3,PVRL3-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL3	226875	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr3	111623667	111623869	111623803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	71988	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr3	114122649	114123036	114122843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	349189	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	121380323	121380507	121380462	Y	CD86,HCLS1,GOLGB1	NA	NA	NA	NA	NA	GOLGB1	86095	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	123396914	123397344	123397115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPLB	94882	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	124188163	124188429	124188181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UMPS	258784	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	126259496	126259659	126259567	Y	ZXDC	NA	NA	NA	NA	NA	ZXDC	66734	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	280334	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	126721076	126721245	126721142	Y	PLXNA1	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	300013	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	126945431	126945830	126945484	Y	MCM2	NA	NUP210P1	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	369236	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	126945882	126946306	126946211	Y	MCM2	NA	NUP210P1	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	368760	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr3	130539887	130540309	130539974	Y	ATP2C1	ATP2C1	ATP2C1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2C1	27130	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	134182898	134183261	134183039	Y	AMOTL2	CEP63,ANAPC13	NA	NA	NA	NA	CEP63	19324	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	135615560	135615771	135615666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R3A	66744	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	141610914	141611173	141610928	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	17948	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	149104739	149105065	149104981	Y	COMMD2,TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF1	11087	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	150478267	150478712	150478564	Y	TSC22D2,SERP1,SELT,GPR171,SIAH2	SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2	552	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	156149618	156149810	156149747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSR3	121163	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	156252887	156253352	156253202	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	17621	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	170444418	170445820	170444586	Y	CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2	NA	CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22L1	140452	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	9.7420139310738
chr3	171002565	171002750	171002646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	173447	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	171684878	171685278	171685188	Y	PLD1,FNDC3B	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	70140	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	177170399	177170552	177170483	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	257138	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	180423868	180424167	180424040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC14	105950	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	188035801	188035961	188035890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP	166729	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	188374364	188374933	188374638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP	505292	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	194247870	194248550	194248205	Y	HES1,ATP13A3	ATP13A3	ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	ATP13A3	30777	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	194461690	194461887	194461800	Y	FAM43A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM43A	57068	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr3	197007663	197007913	197007866	Y	NA	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	16258	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	924714	925388	925028	Y	MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,IDUA,GAK	GAK,TMEM175	NA	NA	NA	NA	TMEM175	539	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	6223621	6224023	6223692	Y	PPP2R2C,PPP2R2C,MRFAP1L1,CRMP1,CRMP1,JAKMIP1	WFS1	NA	NA	NA	NA	WFS1	45553	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	6734442	6734743	6734533	Y	KIAA0232	MRFAP1L1,KIAA0232	NA	NA	NA	NA	MRFAP1L1	24835	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	8561379	8561777	8561592	Y	GPR78	CPZ	NA	NA	NA	NA	CPZ	30610	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	10960524	10960737	10960631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF518B	503490	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	13922430	13922925	13922628	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01085	188667	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr4	15036867	15037072	15036952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CC2D2A	432417	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	24262994	24263251	24263044	Y	NA	NA	PPARGC1A	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	320922	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	28724685	28725033	28724859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH7	1995004	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	35022631	35023155	35023089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELL1	2662843	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr4	38859134	38859762	38859410	Y	KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6	FAM114A1	NA	NA	NA	NA	FAM114A1	7536	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	54794044	54794386	54794192	Y	NA	NA	SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	134471	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	56795274	56795608	56795460	Y	EXOC1,CEP135	CEP135	SRD5A3,CEP135	IMR90	Hi-C	24141950	CEP135	17429	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	74975298	74975961	74975834	Y	CXCL1,AREG	MTHFD2L	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	1930	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	75409847	75410209	75409849	Y	NA	NA	EREG	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MTHFD2L	431956	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	75828847	75828855	75828851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP6	608301	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	77546849	77546886	77546883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT11	321970	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	83912303	83912539	83912423	Y	NA	LIN54,COPS4	NA	NA	NA	NA	LIN54	19540	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	89368459	89368755	89368678	Y	NA	HERC5	NA	NA	NA	NA	HERC5	7513	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	91039777	91039927	91039866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNCA	282311	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	95373822	95374139	95373960	Y	PDLIM5	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	2785	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	100325584	100326020	100325850	Y	ADH5,ADH4,ADH6,ADH1A,ADH1B,ADH1C	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5	317632	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr4	102894116	102894225	102894174	Y	BANK1,BANK1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A8	456190	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	121010657	121011025	121010845	Y	NA	MAD2L1	NDNF	IMR90	Hi-C	24141950	MAD2L1	24428	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	130454629	130454880	130454679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-420A23.1	1242723	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	139250529	139250714	139250650	Y	SLC7A11	NA	NA	NA	NA	NA	SLC7A11	89026	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	143588065	143588407	143588236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	178178	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	148981855	148982042	148981912	Y	PRMT10,NR3C2	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	330641	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	149756405	149756578	149756515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	1105191	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	151146456	151146697	151146576	Y	DCLK2	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK2	149030	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	154035952	154036270	154036100	Y	KIAA0922,TIGD4	NA	KIAA0922,ARFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	FHDC1	180448	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	155148499	155148707	155148553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLRG1	320880	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	179336968	179337246	179337206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGA	975311	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	183568083	183568352	183568218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	268737	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	183935008	183935168	183935057	Y	NA	NA	WWC2,FAM92A3,ODZ3,CLDN24	IMR90	Hi-C	24141950	WWC2	83278	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	184256615	184256836	184256706	Y	NA	NA	CLDN24,CLDN22	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN2AIP	106908	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	184387095	184387281	184387201	Y	C4orf41,CDKN2AIP	CDKN2AIP,ING2	NA	NA	NA	NA	CDKN2AIP	23351	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	186227102	186227608	186227442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD37	87567	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	187591076	187591113	187591095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAT1	54763	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	189361062	189361328	189361166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	1498615	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	190708637	190708848	190708802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	151095	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr4	190936592	190936699	190936668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	76649	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	53990	54174	54063	Y	PLEKHG4B,C5orf55	NA	LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC127	162156	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TRIP13	105735	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN2	81469	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr5	14186205	14186627	14186374	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	44394	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	14268390	14268821	14268476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	126579	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	31894536	31894834	31894609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	277622	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	32772062	32772072	32772067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUB1	242323	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	33789074	33789288	33789217	Y	ADAMTS12	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	101009	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	35405015	35405048	35405025	Y	NA	NA	SPEF2	IMR90	Hi-C	24141950	SPEF2	210898	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	39399549	39400018	39399831	Y	NA	C9	NA	NA	NA	NA	C9	22952	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	42468582	42468751	42468671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPP1	416743	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	43051482	43051716	43051600	Y	NA	ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	ZNF131	11562	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	58232883	58233370	58233101	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	478796	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	60736184	60736544	60736365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	50486	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	60921621	60921766	60921694	Y	C5orf64	NA	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	235923	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	73612322	73612454	73612340	Y	NA	NA	RGNEF,ENC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEXB	321394	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	77800435	77801147	77800993	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	146096	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	77803150	77803526	77803443	Y	AP3B1,LHFPL2,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	148811	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	77882234	77882399	77882291	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	227895	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	2217	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	83018086	83018575	83018426	Y	NA	HAPLN1	NA	NA	NA	NA	HAPLN1	2654	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	86417910	86418259	86418047	Y	NA	NA	MIR4280	K562	ChIA-PET	22265404	RASA1	143446	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	99382569	99383254	99382906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM174A	485755	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	131595834	131595951	131595900	Y	KIF3A,PDLIM4	PDLIM4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	4470	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	7.79361114485904
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	1162	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	5.84520835864428
chr5	135357182	135357477	135357330	Y	NA	NA	VTRNA2-1,TGFBI,FBXL21,LECT2,SMAD5	IMR90	Hi-C	24141950	FBXL21	93176	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	136795919	136796307	136796181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK1	135761	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	140420005	140420137	140420073	Y	NA	NA	PCDHA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PCDHB2	52090	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	142384131	142384662	142384553	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	236182	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	148510344	148510723	148510652	Y	NA	ABLIM3	AFAP1L1,SH3TC2,ABLIM3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ABLIM3	8323	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	148591795	148592037	148591918	Y	ABLIM3	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L1	57397	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	148869266	148869383	148869317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1	59624	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	149267173	149267449	149267330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	70851	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	149518246	149518623	149518550	Y	NA	PDGFRB	NA	NA	NA	NA	PDGFRB	14812	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	7.79361114485904
chr5	150163031	150163501	150163387	Y	TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,C5orf62	DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	26360	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	167752204	167752623	167752553	Y	PANK3	WWC1	RARS	IMR90	Hi-C	24141950	WWC1	35548	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	168221385	168221766	168221495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-575D19.1	180068	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	169404223	169404546	169404350	Y	FAM196B	FAM196B	NA	NA	NA	NA	FAM196B	1198	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	172160417	172160946	172160788	Y	ATP6V0E1	DUSP1	ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	35252	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	172226784	172227709	172227394	Y	ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1,ERGIC1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	30586	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	177645267	177645446	177645363	Y	N4BP3,CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15759	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr5	178259703	178260206	178260005	Y	ZNF879	ZNF354B	ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF354B	24748	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	15.5872222897181
chr6	1131986	1132306	1132130	Y	NA	NA	LOC285768	IMR90	Hi-C	24141950	FOXF2	255763	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	7.79361114485904
chr6	3356099	3356749	3356628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMG4	126462	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	4582137	4582541	4582469	Y	NA	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	121852	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	5157743	5158129	5157936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	101043	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	418263	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	10441526	10441791	10441655	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,GCNT2,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A,GCNT2	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	23634	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	12288026	12288260	12288136	Y	NA	EDN1	NA	NA	NA	NA	EDN1	336	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	13096654	13096703	13096662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-11P	115585	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	13630387	13630831	13630754	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	16828	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	14733801	14734229	14733883	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	510298	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	14744083	14744613	14744392	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	499914	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	14766593	14766865	14766789	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	477662	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	15436683	15436898	15436793	Y	JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2	192156	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	16690265	16690543	16690477	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	68826	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	17715315	17715544	17715493	Y	NUP153	NUP153	NUP153,KIF13A	IMR90	Hi-C	24141950	NUP153	10659	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	21947021	21947287	21947156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	355049	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	24698648	24698887	24698768	Y	NA	TDP2,ACOT13,C6orf62	NA	NA	NA	NA	C6orf62	20177	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H3A,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB	NA	NA	NA	NA	HIST1H3A	25645	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	26533222	26533398	26533310	Y	NA	HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	3235	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	27071259	27071558	27071409	Y	NA	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H2BK,HIST1H2AH	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BJ	26983	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	27145729	27146130	27146023	Y	ZNF184	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H2BK,HIST1H2AH	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HIST1H2AH	32868	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	30716597	30717062	30716912	Y	IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	6266	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	36321421	36321620	36321472	Y	CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD20	86924	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	5.84520835864428
chr6	36737758	36737957	36737899	Y	ETV7,ETV7,PXT1,PIM1	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1A	95453	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	37424991	37425195	37425093	Y	NA	CCDC167	CCDC167	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC167	40503	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	40904550	40904902	40904649	Y	UNC5CL	NA	APOBEC2,C6orf130,TSPO2,UNC5CL	IMR90	Hi-C	24141950	NFYA	133782	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	43978439	43978901	43978686	Y	NFKBIE	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1120P11.1	61488	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	43979820	43980209	43980006	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1120P11.1	60180	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr6	44002049	44002379	44002368	Y	NFKBIE,GTPBP2	RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.1	38010	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	44949602	44949944	44949774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RUNX2	343950	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	45390987	45391259	45391097	Y	RUNX2	NA	NA	NA	NA	NA	RUNX2	97093	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	45618234	45618676	45618425	Y	RUNX2	NA	RUNX2,SUPT3H,CLIC5	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX2	324340	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr6	45623562	45623937	45623654	Y	NA	NA	RUNX2,SUPT3H,CLIC5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RUNX2	329668	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr6	48967422	48967791	48967607	Y	MUT	NA	NA	NA	NA	NA	MUT	461113	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	86113432	86113601	86113525	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	44208	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	86370103	86370257	86370180	Y	NA	SYNCRIP,SNHG5	NA	NA	NA	NA	SNHG5	16194	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	111382725	111382978	111382849	Y	AMD1,AMD1,REV3L,SLC16A10	NA	NA	NA	NA	NA	RPF2	81507	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr6	112078631	112078983	112078811	Y	REV3L,FYN,FYN,FYN	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	113672	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	113975639	113976185	113975774	Y	MARCKS	NA	MARCKS	IMR90	Hi-C	24141950	MARCKS	200356	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	116469368	116469398	116469382	Y	NA	NT5DC1,COL10A1	NA	NA	NA	NA	COL10A1	8512	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	125952984	125953298	125953141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEY2	113512	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	130005105	130005433	130005370	Y	L3MBTL3,ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	23937	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	145438577	145438785	145438681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPM2A	616375	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	154753926	154754309	154754118	Y	CNKSR3	NA	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	75484	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	157096939	157097165	157097038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	0	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr6	157342507	157343524	157343342	Y	ARID1B,ZDHHC14	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	245444	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	158478416	158478907	158478642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	77528	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	158670119	158670409	158670245	Y	NA	NA	TULP4,TMEM181	IMR90	Hi-C	24141950	GTF2H5	82735	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	159141436	159141829	159141621	Y	TAGAP,DYNLT1,SYTL3,C6orf99,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	77665	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	159270971	159271326	159271104	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	32527	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	159271429	159272000	159271674	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	32985	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	161855973	161856365	161856002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	162880	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	163833938	163834442	163834340	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	906	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr6	168493730	168493970	168493824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT4	268128	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr7	1560213	1560697	1560426	Y	C7orf50,TMEM184A,PSMG3,PSMG3,MAFK	INTS1,MAFK,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	7653	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	2903227	2903785	2903462	Y	LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12	AC006028.11,GNA12	GNA12	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNA12	21269	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr7	4773909	4774305	4774006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	92521	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	5740810	5741077	5740967	Y	WIPI2,ACTB,USP42,RNF216	NA	NA	NA	NA	NA	RNF216	78293	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	20837430	20837819	20837731	Y	SP8	NA	SP8	K562	ChIA-PET	22265404	ITGB8	469105	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	24861129	24861331	24861204	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	53885	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	25064852	25065012	25064919	Y	NA	OSBPL3	OSBPL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL3	45599	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	5.84520835864428
chr7	25897167	25897316	25897282	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292544	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	28000804	28001209	28000940	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAZF1-AS1	216732	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	29377353	29377591	29377403	Y	CHN2	NA	NA	NA	NA	NA	SCRN1	650314	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	30208837	30209260	30209012	Y	ZNRF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	112663	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	30387689	30388072	30387783	Y	NOD1,ZNRF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	65766	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	36556926	36557226	36557208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	129192	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	43676905	43677264	43677045	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	NA	NA	NA	NA	NA	STK17A	56548	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	46186122	46186484	46186177	Y	IGFBP3	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	226649	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	46186512	46186858	46186578	Y	IGFBP3	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	227039	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	47390589	47390737	47390670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	229419	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	47797544	47797859	47797606	Y	NA	C7orf69	NA	NA	NA	NA	C7orf69	35030	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	56606357	56606502	56606382	Y	LOC389493	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	434088	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	57639323	57639702	57639567	Y	ZNF479,ZNF716	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF716	131440	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	25.3292362207919
chr7	63924105	63924304	63924148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF680	97180	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr7	65790150	65790379	65790243	Y	RABGEF1,KCTD7,TPST1	NA	LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	TPST1	121964	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	69215481	69215818	69215531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	153576	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	88029071	88029091	88029081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRI	174763	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	91466585	91467314	91466893	Y	NA	MTERF	NA	NA	NA	NA	MTERF	40720	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	92533719	92534002	92533863	Y	SAMD9	NA	FAM133B	IMR90	Hi-C	24141950	CDK6	69811	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	94021237	94021945	94021560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL1A2	0	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr7	96646199	96646417	96646378	Y	DLX6,DLX5	DLX5	NA	NA	NA	NA	DLX5	5992	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	100761754	100762006	100761835	Y	NA	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	AP1S1,VGF	MCF7	ChIA-PET	22265404	SERPINE1	6364	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	101525517	101525682	101525579	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	68558	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	104597631	104597869	104597756	Y	MLL5	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	53622	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	111024464	111024780	111024739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	175793	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	116328034	116328226	116328184	Y	ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET	MET	NA	NA	NA	NA	MET	17590	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	7.79361114485904
chr7	120532080	120532359	120532220	Y	NA	TSPAN12	NA	NA	NA	NA	TSPAN12	35624	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	9.7420139310738
chr7	129246747	129246901	129246817	Y	NA	NRF1	NRF1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	2654	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	129465628	129465864	129465722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	124925	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	134117156	134117311	134117298	Y	NA	AKR1B1	NA	NA	NA	NA	AKR1B1	24725	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	135443440	135443607	135443468	Y	FAM180A	FAM180A	C7orf73,SLC13A4	IMR90	Hi-C	24141950	FAM180A	11846	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	137372806	137372951	137372895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	311862	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	137573369	137573542	137573460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	111271	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	139577679	139577876	139577701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	102102	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	172	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	151182414	151182755	151182660	Y	AGAP3,PRKAG2	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	32451	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	151823102	151823484	151823293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT11	102343	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	154999343	155001070	155000829	Y	NA	NA	INSIG1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	INSIG1	86416	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	155276719	155276807	155276762	Y	PAXIP1,CNPY1	NA	NA	NA	NA	NA	RBM33	158338	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr7	156111013	156111412	156111192	Y	RNF32,RNF32,RNF32	NA	NA	NA	NA	NA	C7orf13	319936	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	10228323	10228440	10228417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	318545	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr8	19075736	19075934	19075838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	135496	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	22516346	22516607	22516450	Y	NA	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	BIN3	8054	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	22808149	22808394	22808223	Y	NA	RHOBTB2	PEBP4,TNFRSF10B,BIN3,EGR3,RHOBTB2	IMR90	Hi-C	24141950	RHOBTB2	34536	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	33579772	33580017	33579844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-273G13.1	135724	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	13.6388195035033
chr8	37002327	37002551	37002443	Y	NA	NA	KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-150O12.1	407150	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	38624356	38624716	38624649	Y	WHSC1L1,LETM2,LETM2,PLEKHA2,TACC1	TACC1	NA	NA	NA	NA	TACC1	40652	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	40032102	40032537	40032342	Y	IDO1	NA	NA	NA	NA	NA	ZMAT4	720815	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	43092918	43093442	43093017	Y	HOOK3	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	99362	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	43093596	43094096	43093640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	100040	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	49320367	49320668	49320511	Y	NA	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2V2	401407	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr8	49426952	49427328	49427172	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	SNAI2	404971	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	53625473	53626379	53625848	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	30024	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	63576156	63576334	63576245	Y	NKAIN3	NA	NA	NA	NA	NA	GGH	373396	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	67424340	67424761	67424541	Y	C8orf45	NA	NA	NA	NA	NA	ADHFE1	83920	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	67433991	67434613	67434592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	89869	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	77469082	77469378	77469240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01111	152193	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	80705910	80706255	80706054	Y	HEY1	NA	HEY1,MRPS28	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS28	234269	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	93963655	93963936	93963796	Y	C8orf83	NA	NA	NA	NA	NA	FAM92A1	744853	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	95271404	95271652	95271620	Y	GEM	GEM	NA	NA	NA	NA	GEM	926	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	101801288	101801504	101801352	Y	NA	NA	PABPC1,SNX31	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PABPC1	68251	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	118776615	118776789	118776702	Y	NA	NA	MED30,EXT1,SAMD12	IMR90	Hi-C	24141950	MED30	245663	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	118885059	118885357	118885328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	236735	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	121822442	121823157	121823030	Y	NA	SNTB1	NA	NA	NA	NA	SNTB1	356	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	125715093	125715423	125715328	Y	NSMCE2,KIAA0196,RNF139,MTSS1	NA	NA	NA	NA	NA	TATDN1	165394	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	128306934	128307283	128307196	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	438397	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	128944008	128944415	128944139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	76442	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	130490796	130491097	130490948	Y	FAM49B	NA	MYC	IMR90	Hi-C	24141950	FAM49B	536278	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	132828459	132829599	132829218	Y	EFR3A	NA	ADCY8	IMR90	Hi-C	24141950	EFR3A	84736	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	134143122	134143607	134143263	Y	ST3GAL1,NDRG1,PHF20L1	NA	NA	NA	NA	NA	WISP1	57675	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	134230111	134230161	134230154	Y	ST3GAL1	WISP1	NA	NA	NA	NA	WISP1	28829	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr8	134233745	134234256	134234169	Y	NA	WISP1	NA	NA	NA	NA	WISP1	32463	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	7.79361114485904
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	5.84520835864428
chr8	145911932	145912089	145912059	Y	SCRT1,KIFC2,LRRC24,ZNF34	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF34	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	2738	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	4340074	4340431	4340362	Y	NA	GLIS3	GLIS3,RFX3,GLIS3-AS1,KIAA0020	IMR90	Hi-C	24141950	GLIS3	5961	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	5879621	5879741	5879699	Y	NA	ERMP1	ERMP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ERMP1	48504	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	11065025	11065362	11065124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRD	454302	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	7.79361114485904
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC21	368559	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr9	14547369	14547550	14547460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC21	143919	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	16062752	16063225	16063009	Y	NA	NA	CNTLN,C9orf93,BNC2	IMR90	Hi-C	24141950	PSIP1	553735	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	18490587	18490949	18490797	Y	ADAMTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RRAGA	556423	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	21576231	21576644	21576439	Y	NA	MIR31HG	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	18563	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	22408637	22408662	22408639	Y	NA	DMRTA1	NA	NA	NA	NA	DMRTA1	36178	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	32535412	32535514	32535462	Y	NA	TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	TOPORS	15037	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	33151008	33151398	33151341	Y	NA	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	13956	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	33229811	33230012	33229910	Y	NA	BAG1,CHMP5	NFX1	MCF7	ChIA-PET	22265404	BAG1	32749	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	35520478	35520852	35520494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	82515	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	35924004	35924206	35924105	Y	NA	HRCT1	NA	NA	NA	NA	HRCT1	19815	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	36621370	36621719	36621545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELK	50511	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	37198449	37198887	37198604	Y	ZBTB5,ZCCHC7	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	79913	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	7.79361114485904
chr9	72725457	72725742	72725656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	146195	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	5.84520835864428
chr9	79383801	79384093	79383990	Y	PRUNE2	NA	NA	NA	NA	NA	PRUNE2	134910	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	81235721	81235973	81235928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAT1	325662	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	86051693	86051979	86051837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD3	99482	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	86785805	86786025	86785915	Y	NA	NA	HNRNPK,RMI1,C9orf64,SLC28A3	IMR90	Hi-C	24141950	RMI1	192179	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	87320052	87320082	87320067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMI1	726426	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	90728260	90728622	90728394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPIN1	272712	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chr9	92040069	92040496	92040389	Y	C9orf47,S1PR3	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA4D	70549	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,HABP4	NA	NA	NA	NA	RP11-172F4.2	13981	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	110512153	110512586	110512216	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF4	261390	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	114720285	114720825	114720474	Y	UGCG	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	63239	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	132319720	132320056	132319894	Y	DOLPP1	NA	FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	75990	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	133736245	133736518	133736410	Y	ABL1	NA	NA	NA	NA	NA	FIBCD1	76155	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	NA	NA	NA	NA	NA	GTF3C5	105055	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	136576519	136576779	136576603	Y	SURF4	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	278947	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	138348639	138348707	138348673	Y	NA	PPP1R26,MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	20218	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	139024359	139024752	139024554	Y	NA	C9orf69	C9orf69	MCF7	ChIA-PET	22265404	C9orf69	15628	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chrX	1435330	1435830	1435673	Y	P2RY8,IL3RA,ASMTL,ASMT,AKAP17A,SLC25A6,ASMTL,CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	73787	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chrX	12228582	12228906	12228588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSL3	454304	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	3.89680557242952
chrX	23922308	23922544	23922448	Y	NA	APOO	NA	NA	NA	NA	APOO	1513	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chrX	99900251	99900361	99900308	Y	SRPX2	TSPAN6,SRPX2	NA	NA	NA	NA	SRPX2	3036	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chrX	123128662	123128935	123128809	Y	XIAP,XIAP,STAG2	STAG2	NA	NA	NA	NA	STAG2	36600	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chrX	128656237	128656454	128656444	Y	NA	SMARCA1,OCRL	NA	NA	NA	NA	SMARCA1	760	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chrX	133847905	133848292	133848163	Y	NA	NA	LOC100506757,FAM122B,PLAC1,MIR450A1,MGC16121,MIR542,MIR450A2,MIR450B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM122B	80970	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chrX	135275239	135275595	135275317	Y	CT45A6,MMGT1,FHL1,FHL1	FHL1	NA	NA	NA	NA	FHL1	47680	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chrX	135940631	135940874	135940833	Y	HTATSF1	RBMX,RP11-308D16.4	NA	NA	NA	NA	RBMX	20049	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chrX	138002307	138002505	138002406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF13	300434	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476
chrX	138007531	138007947	138007713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF13	294992	CAGE	SW 1353	hg19	FANTOM5	1.94840278621476